特別史跡は、国が文化財保護法で指定した史跡のうち、特に歴史上、学術上の価値が高いもの。同館では、埼玉古墳群の保存と活用、整備を目的に、発掘調査を実施しており、2024年度は愛宕山古墳の東側と南側の墳丘の構造や周堀の状況について、発掘調査をした。